Film, küçük yaşta annelerini kaybeden iki kardeşin hikâyesini konu edinir. Annelerini kaybeden Ahmet ve Ayşe, babalarının yeni eşi tarafından kabul edilmez. Almanya’da yaşayan teyzeleri, dedelerinin yanında kalan Ayşe ve Ahmet’i yanlarına almayı düşünmektedir. Bu sırada zengin bir aile Ayşe’yi evlatlık almak ister. Bu durum kardeşlerin ayrılma ihtimalini de beraberinde getirecektir. Kız kardeşi Ayşe’ye hem ağabey, hem baba, hem anne, hem de bir bilge olmaya çalışan 9 yaşındaki bir çocuk ile kardeşinin serüvenini konu alan ”Mommo–Kızkardeşim”, yoksul, kimsesiz çocuk olma hallerini son derece duyarlı ve dokunaklı biçimde anlatmış, kazandığı başarılarla ülkemiz sinema tarihinde yerini almıştır.